El F-4D fue el primer Phantom con caracterisitcas especiales para la USAF, en vez de la version desnavalizada F-4C, el ala tenia un abultamiento mayor, para la rueda del tren de aterrizaje mas ancho, antenas de navegacion para sistemas terrestres, designadores especiales y e los modelos finales, antenas especiales y supresion del designador IR
